Клинические лабораторные исследования назначаются для установления и подтверждения диагноза, дифференциальной диагностики заболеваний, определения прогноза и обоснования тактики лечения. При помощи анализов, проведённых в лаборатории, можно обнаружить начальные стадии болезни, когда самих симптомов ещё нет.
В клинико-диагностической лаборатории НИИ кардиологии и внутренних болезней выполняются гематологические, общеклинические, биохимические, серологические, иммунологические исследования, также исследования свертывающей системы.
В 2020 году лабораторией в рамках гарантированного объема бесплатной медицинской помощи было проведено 194 590 лабораторных исследований, что на 61 883 (31,9%) больше, чем в предыдущем году. Увеличение количества исследований связано с дополнительным объемом оказания стационарной помощи населению в рамках ГОБМП. Лабораторные услуги также выполнены и по хозрасчету.
Внедрены и освоены новые методы исследования антител: к односпиральной и двуспиральной ДНК, ядерным антигенам, митохондриям, также цитоплазме нейтрофилов в крови для дифференциальной диагностики язвенного колита и болезни Крона, быстро прогрессирующего гломерулонефрита и др.